Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCKBRP32239 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms