Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC13P31276 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms