Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTAFRP25105 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms