Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CCL3L1P16619 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CCL3L1P16619 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCL3L1P16619 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCL3L1P16619 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCL3L1P16619 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCL3L1P16619 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCL3L1P16619 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CCL3L1P16619 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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