Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HOXB1P14653 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HOXB1P14653 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HOXB1P14653 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HOXB1P14653 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HOXB1P14653 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HOXB1P14653 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HOXB1P14653 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HOXB1P14653 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXB1P14653 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXB1P14653 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 AC098617.1-207ENST00000594591 810 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXB1P14653 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB1P14653 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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