Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEPDP12955 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEPDP12955 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEPDP12955 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEPDP12955 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEPDP12955 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PEPDP12955 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEPDP12955 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEPDP12955 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEPDP12955 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEPDP12955 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEPDP12955 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PEPDP12955 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEPDP12955 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEPDP12955 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEPDP12955 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PEPDP12955 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEPDP12955 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PEPDP12955 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEPDP12955 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PEPDP12955 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEPDP12955 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEPDP12955 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEPDP12955 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PEPDP12955 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEPDP12955 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PEPDP12955 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PEPDP12955 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PEPDP12955 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PEPDP12955 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEPDP12955 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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