Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C8orf88P0DMB2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms