Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms