Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms