Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBAL3A6NHL2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms