Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms