Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
THRAP3Q9Y2W1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
THRAP3Q9Y2W1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THRAP3Q9Y2W1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms