Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPR55Q9Y2T6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPR55Q9Y2T6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPR55Q9Y2T6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPR55Q9Y2T6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPR55Q9Y2T6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPR55Q9Y2T6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPR55Q9Y2T6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPR55Q9Y2T6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPR55Q9Y2T6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPR55Q9Y2T6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPR55Q9Y2T6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPR55Q9Y2T6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPR55Q9Y2T6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPR55Q9Y2T6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms