Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms