Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms