Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms