Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms