Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms