Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms