Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC24A3Q9HC58 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms