Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms