Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM55Q9BYV6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms