Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms