Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms