Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms