Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGMNQ99538 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms