Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CDRT15Q96T59 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CDRT15Q96T59 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CDRT15Q96T59 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CDRT15Q96T59 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CDRT15Q96T59 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CDRT15Q96T59 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CDRT15Q96T59 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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