Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms