Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms