Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms