Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms