Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms