Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms