Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms