Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RNF148Q8N7C7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RNF148Q8N7C7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RNF148Q8N7C7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RNF148Q8N7C7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RNF148Q8N7C7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RNF148Q8N7C7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RNF148Q8N7C7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RNF148Q8N7C7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RNF148Q8N7C7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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