Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms