Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms