Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms