Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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