Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms