Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMBOX1Q6NT76 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms