Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms