Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C3orf38Q5JPI3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms