Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms