Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms