Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NDUFA9Q16795 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NDUFA9Q16795 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NDUFA9Q16795 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NDUFA9Q16795 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NDUFA9Q16795 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NDUFA9Q16795 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NDUFA9Q16795 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NDUFA9Q16795 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NDUFA9Q16795 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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NDUFA9Q16795 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms