Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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