Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEA1Q15075 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms