Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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