Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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